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瑞穂MSC高等学校はネットコース、通学週1日コース、通学週3日コースを提供し、オンライン学習中心に個別カリキュラムで単位取得を目指す。担任の進捗管理とAI動画学習（すらら）が特徴。本校は石垣島で、キャンパスは東京・神戸・石垣島の3か所、全国14か所の学習室が平日9-17時自由利用可。スクーリングは年5日程度で1・3年次は全国10会場（札幌・東京・千葉・埼玉・愛知・大阪・神戸・福岡・沖縄本島・石垣島）選択可、2年次は原則石垣島、家族同伴可。週3日コースはMゼミ（推し探究・e-Sports等）受講可能。2026年4月よりオプションコース開講。

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